本不可能存在的神秘凶恶怪兽·宇宙人们来袭了！赛罗、利布特、泰迦、泽塔、爱迪、麦克斯、梦比优斯、葛雷、帕瓦特、格丽乔......还有更多的奥特英雄将共同加入战斗，向震撼全宇宙的令人费解的事件发起挑战。然而这一切，只不过是从现在开始的大乱斗的序章而已！

身分是豆腐店的儿子、在加油站打工的高中3年级的学生藤原拓海。此时在他周遭有着不寻常的骚动。传说前一阵子秋名山・山顶下坡路段的甩尾胜负中，赤城Red suns的No.2高桥启介所驾驶最新锐的黄色RX-7，被一台神秘的熊猫配色AE86（通称86）轻易地超车。事实上，两台的性能差在200马力以上。其令人难以置信的速度，就连被超车的启介也认为难道是秋名的幽灵吗。不久，赤城Red suns在秋名山上集结，对着目击了那场胜负的秋名高速之星的队长池谷提出交流赛的邀约，然而对战对手竟指名要86。

身分是豆腐店的儿子、在加油站打工的高中3年级的学生藤原拓海。“秋名的86”，被视为打败赤城Red suns高桥启介的神秘下坡专家，这个名称在车手之间瞬时传开，许多对自己的技术有信心的车手们，都陆陆续续聚集到秋名。某夜，驾驶FC攻下秋名山顶的高桥凉介，与中里毅所驾驶的GT-R，两辆车的大灯在此交会。另一方面，被池谷跟阿树两人称赞为“车手”的藤原拓海，虽感到困惑却也被周遭的热情所感染。但就在这时，阿树因为过于得意忘形，而擅自接受了来自妙义黑夜小子的中里毅所下的挑战…

“梦现。”面对与赤城最快的男人‧高桥凉介的比赛，拓海如此喃喃自语。高桥凉介的身影在他的脑里不断变大。曾经认为自己不是车手也罢，不管是对为了替家里的豆腐店帮忙而驾驶的86，还是对山坡上的对决都没有半点兴趣的那个青年，发现自己的内心起了某种变化。另一方面，高桥凉介调整了自己的FC3S。他最后的判断是降低规格。从340匹马力调降到260匹马力，他认为整体的平衡性比爆发力还要重要。“真是屈辱”－－笑容从这么说着的凉介嘴角上消失了。

数千年后的未来，进入宇宙空间的人类，被分为银河帝国与自由行星同盟这两个拥有"专制政治"与"民主主义"两种不同政治体制的国家。两国之间的抗争持续了150年，以无边无际的广袤银河为舞台，重复着无止境的战斗。银河帝国的门阀贵族社会的腐败，以及在自由行星同盟中被称为"民主主义的弊端"的群愚政治正侵蚀着两个国家。之后，宇宙历8世纪末，两位天才的登场驱动了历史。"常胜的天才"

奥特战士们的故乡——M78星云“光之国”遭到神秘敌人的突然袭击，赛罗奥特曼对自己的力量过于自信，差点失手。在父亲赛文奥特曼的帮助下，赛罗奥特曼成功突围并消灭了敌人。为了弥补自己的草率，赛罗奥特曼只身一人担负起一探敌人真正身份的任务。他戴着父亲给予他的万能物品——奥特手镯，向着未知的宇宙空间，独自踏上旅途。在旅途中，赛罗感受到有声音在召唤他，赛罗跟着召唤他的声音，来到了一个未知的行星。赛罗在拯救行星上的人们时，他和身负重伤、奄奄一息的青年“岚”以及他的弟弟“小治”相遇。赛罗奥特曼被岚的勇气所感动，与他合为一

重回过去，再现奇迹。泽塔奥特曼是赛罗奥特曼的徒弟，拥有着和赛罗一样的热心肠，是一位非常积极向上的奥特英雄。而且，泽塔非常崇拜他的师父赛罗。赛罗虽然嘴上不承认这个徒弟，但其实心里还是很看好泽塔的。赛罗和他的徒弟泽塔为了守卫家园，主动出击迎战敌人。一场激战过后，泽塔被迫与赛罗分开，独自一人追逐逃跑的怪兽。泽塔抵达地球的时候，遇到了正在战斗的遥辉。两人的相遇，拉开了故事的序幕。迪迦奥特曼是超古代时期就出现在地球的巨人，但并非是地球出生的奥特曼，他原本是和三个黑暗巨人在一起的邪恶奥特曼，也是其中的领袖。后在超古代

宇宙发生了异变，新的强敌出现！许多不该出现的凶恶怪兽和外星人纷纷出现！有人在偷偷谋划一场巨大的阴谋，如今，阴谋渐渐浮出水面。众多奥特战士们联手，前来解开谜团的真相。

该作讲述的是赛罗奥特曼与他的宿敌贝利亚奥特曼等强敌对战的故事。