《小小飞虎队》讲述了抗日战争时期的山东枣庄，三个小孩子大壮、虎子、小银，因为崇拜飞虎队（铁道游击队），而成立小飞虎队。可他们毕竟都是十几岁的孩子，想法很好，实现不了打鬼子的愿望，只能捉弄当地日本战站长儿子喜郎和二鬼子孙二狗。从而发生了以串串具有喜感有惊心动魄的故事。

该片讲述了抗战时期的鲁南，交通员老吴在给山里八路军送情报的路上突遭日军的追杀，在万不得已的情形下他将情报编成两句暗语告诉了正在芦苇荡玩的小主人公——大壮，自此，胆小、笨拙而又“一根筋”的大壮拉上同村的虎子和小银踏上了前途未卜的送情报之旅。