经过伙伴们共同的努力，重返X星球的宇宙飞船基本制造完成，接下来轮到怪粒鼠负责搭建排水系统和空调系统。怪粒鼠有一本厚厚的记事本，上面记载着所有研发两大系统所需的材料，却不小心被捣蛋猫骗走。每当酷宝们寻找材料时，捣蛋猫总能抢先一步。历尽千辛万苦，怪粒鼠和伙伴们终于搜集到原材料。

保护熊猫村的任务落到了奇异狗身上。奇异狗在熊猫村布置了警报与雷达系统，让捣蛋猫吃尽苦头。奇异狗不仅要面对捣蛋猫的挑战，还要运用他灵敏的鼻子，帮助村民解决各种难题。

爱好音乐歌唱的山寨鸡接管了熊猫村，她架起了音响设备与广播电台，每天播放悦耳的音乐。捣蛋猫则四处破坏乐器与扩音设备，山寨鸡为保护音乐，与捣蛋猫展开声音大战。

弥勒猴是十二个酷宝中最调皮的一个。他虽然从小神羊手中接下了修复飞船的工作，但他更乐意研发制造攻击性武器与防御系统。弥勒猴不仅没有为熊猫村带来安定和平，反而常常让大家陷入混乱。

轮到十二生肖中的笨笨猪上班了，他负责驾驶训练，以及方向盘的改良与设计。但他贪吃偷懒，常常驾着飞天敞篷车躲到圆圆山的荒郊野外，大吃汉堡与呼呼大睡。捣蛋猫看准了笨笨猪的弱点，不断设计引诱笨笨猪中计与犯错。但笨笨猪傻猪有傻福，总能在千钧一发之际，借着种种科技法宝化险为夷，笨笨猪完成了他的飞船任务。

为保卫天城家园，阻止冥王堡人掠夺天城红晶石宝矿的阴谋，守宝家族的水爷爷秘密地将开启宝矿的5件法宝分别交给了火龙、水花、土生、木瓜和金灵。从此这5个少年与天城命运和宝矿存亡紧紧相连。其次，水灵就是冥王堡的小公主勇敢的五行少年让天城人醒悟了，原来懦弱、自私的如意兔市民站了出来，依靠团结最终打败了冥王堡人，保住了天城自己美丽的家园。

七彩蛇负责修复飞行船的机身，历经千辛万苦，才把要修复机身的各种材料搜集齐全。捣蛋猫想要窃取机身，研发了懒散粉，传播怪病毒，甚至还假冒成七彩蛇的模样要偷飞行船，但最终都失败了。

小神羊与嘟嘟搜集了流星石与灯心草等材料，用来制作计算器系统的线路与零件。虽然偶尔有捣蛋猫的作乱，不过两人运用自身的智慧与勇气，使有关问题迎刃而解。

负责修复飞天号引擎的沙奇马总是骑着自己的爱车马赫两千号穿梭在熊猫村里主持正义。他不但要处理所有捣蛋猫惹的祸端，还要带着嘟嘟飞天遁地四处冒险。沙奇马和嘟嘟经历了重重困难，终于完成了离子引擎。而一旁窥视着的捣蛋猫，也发明了更多稀奇古怪的东西想要窃取引擎。不过，捣蛋猫总是因为自己的这些发明，而自食恶果。

一艘名为“飞天号”的宇宙飞船，紧急迫降到地球上的熊猫王国。熊猫小嘟嘟将12位船员带进家中，不巧也被恶名昭彰的捣蛋猫盯上。船员保丽龙负责修复飞船，他到处搜寻可用的材料与能量，捣蛋猫则在暗中破坏，不断偷取他们的实验材料。保丽龙忙着修复机翼，又要应付神秘的捣蛋猫，还要帮助小嘟嘟度过成长难关。