泽塔奥特曼是登场10周年的赛罗奥特曼的徒弟，拥有着和赛罗一样的热心肠，是一位不断前进、永不放弃的奥特英雄。他怀着对赛罗的憧憬，依靠不懈的努力，成为了宇宙警备队的一员。泽塔奥特曼的人类形态夏川春树（暂译 由平野宏周饰演）是怪兽应对机甲部队“军械库（storage暂译）”的一员。本作着重叙述泽塔奥特曼、夏川春树两位主角共同成长的故事。

很久以前，在宇宙中被粉碎的恶魔碎片，如今仍然祸乱着整个宇宙。一名不知其真面目的恶徒正借着这些恶魔碎片危害四方，并将其魔爪伸向了光之国。赛罗奥特曼和他的徒弟泽塔奥特曼勇敢地站了出来，正面迎击敌人。经过一番激战，泽塔奥特曼独自一人追着怪兽前往地球。在地球上，人们为了对抗日常出现的怪兽组成了防卫军——怪兽应对机甲部队“军械库（STORAGE）”。在这支部队中有一位热血青年——夏川遥辉。宇宙怪兽到达地球的那一刻，泽塔奥特曼和遥辉相遇了，自此两位热血青年的战斗故事开始了。

该作讲述的是兄弟两人哥哥凑活海、弟弟凑勇海获得了罗布回旋闪光与罗布水晶，分别变身为充满火元素之力的罗索奥特曼，以及充满水元素之力的布鲁奥特曼，并与敌人展开战斗的故事。

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很久以前，地狱的芭罗慈遗迹被成功的封印了。如果那个封印被解除拥有灭世之力的上古地狱阎魔兽扎伊古将复活。邪恶之力蠢蠢欲动。为了阻止这一切，天空大地等特殊防卫队的队员和考古学家玉城有司前往遗迹一探究竟。

有一天SSP成员收到了寄来的神秘道具。那是艾克斯奥特曼的变身器艾克斯终端。落入敌人的陷阱而解除与Xio队员大空大地一体化的艾克斯奥特曼，SSP，流浪之旅行归来的凯，还有行踪不明的大地！地球新危机的前兆降临！寻找宇宙中拥有邪恶之心的人，拥有放大持有者的能力的黑暗圆环。准备用它将一切的美丽的东西作为宝石收藏的邪恶的宇宙魔女贼穆鲁娜奥。她已经收集了银河和维克特利的宝石，如今有了新的目标，准备把地球化成宝石收藏，似乎有什么企图的伽古拉暗中开始活动。在穆鲁娜奥率领的邪恶宇宙人军团的面前，艾克斯将要被它们变成宝石！

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很久以前，地狱的芭罗慈遗迹被成功的封印了。如果那个封印被解除拥有灭世之力的上古地狱阎魔兽扎伊古将复活。邪恶之力蠢蠢欲动。为了阻止这一切，天空大地等特殊防卫队的队员和考古学家玉城有司前往遗迹一探究竟。