神奇宝贝2013年新剧场版标题正式定名为《神速的灭世虫》，并预定于2013年7月13日上映，届时，附加短篇《皮卡丘与伊布好朋友》也会同时公开。　　本次即将与明年7月上映的剧场版是《宠物小精灵》系列的第16部剧场版动画，上一部作品名为《宠物小精灵 Best Wishes 酋雷姆VS圣剑士》，而新作则是以被真红之铠包裹着，曾在3亿年前被等离子团改造了的口袋妖怪盖诺赛特为主角，在特报中登场的正是被称为“神速的灭世虫”(又译：盖诺赛特)的口袋妖怪，它比平常的盖诺赛特行动更快速，能力更强劲！尤其是在“高速飞行行态”

十五年前,神明大人将世界整个舍弃.没有人出生,也没有人死亡.在绝望遍布的世界中能给予死者唯一慰藉的存在是"墓守".爱是一位墓守.今天也整整挖了47个坟墓.晚上回到村子与温柔的村民们围在一起嬉戏.但是那一天有什么不对.银色的头发,红玉般的双瞳.令人叹息的美貌,名为食人玩具的少年……那一天,爱,与他两人命运般的相遇."我是一名墓守人.我,绝对不会让这个世界毁灭!" 于是,保护最后的世界的少女与仍旧猎杀死者的

　　故事以一名出身最底层的少年佣兵飞行员与一位身为未来皇妃的少女而展开——从小被当作政治筹码来培养而封闭了心灵的少女法娜在小时候与一位名叫查尔斯的少年相遇,少年因为与少女那次邂逅而使得自己没有走上歪路.时光飞逝,少女成为了未来皇妃,而少年实现了自己的梦想成为了飞行员,然而在某一天,上司下达了任务让查尔斯去完成一个任务,而这个任务就是用水上侦察机搭载法娜从敌人中突破飞过中央海……一万两千公里的旅程、一段无法实现的恋情、一个感人的故事就此开幕……

持续旅行的小智一行人，来到了被丰富自然的河川环绕的城镇米季纳。这个城镇里拥有数千年前的遗迹，小智等人在巨大的岩山上朝遗迹前进。突然，遗迹附近的湖刮起了水龙卷并向小智等人逼进，就在快被龙卷风卷入时，随着“帝牙卢卡，拜托了！”的声音出现了一名女性。下一刻，撕开空间的帝牙卢卡出现了。这位名叫“希娜”的女性，是遗迹的守护者，拥有与神奇宝贝心灵相通的能力。在希娜的邀请下，让小智他们使用时空仪来说明有关帝牙卢卡、帕路奇犽、骑拉帝纳的空间，并说起了在米季纳关于被称为诞生一切的幻之神奇宝贝“阿尔宙斯”的古老传说…。

水都奥多马雷，相传在这里有两只传说神奇宝贝-拉帝欧斯与拉帝亚斯，秘密的看守着守护这座城市的宝石-心之水滴。小智一行人正好造访这里，参加完水上竞速赛后，并从当地居民口中得知这项传说。这时，闻名世界的怪盗姊妹出现了，她们为了夺取心之水滴，利用探测器，找出了变成人型的拉帝亚斯，想借此查出心之水滴的下落，正好被小智撞见。怪盗姊妹想利用心之水滴的力量掌控整个水都奥多马雷，小智该如何制止她们的计划？

故事发生在一座被称为“黑奇萨威”的架空都市之中，在这座都市建筑林立，经过常年的发展，城市的各个区域特点分明，但同时和所有城市一样，在城市的一角有着一大片密集的贫民聚集地。于此同时，经常发生“重力飓风”，将城市推向了毁灭的边缘。

「猛毒の少女は、爱を求めた。」被称作怪物、全身有着剧毒的少女Cardia，某个夜里，与自称怪盗绅士的男子邂逅了。被这个男子——亚森·罗宾引导着，少女来到了钢铁都伦敦。在陌生的土地上遇见各种各样的人，以及继次编制而出的，谜样的物语。被称为怪物的少女，最终寻得的答案是——

居酒屋“阿信”是由大将矢泽信之与女服务生千家忍努力经营的小店。但不知为何，居酒屋正门却连接着异世界的城镇，古都阿伊特力亚。光顾“阿信”的都是一些个性独特的客人，比如懒惰的卫兵、低调的圣职人员，还有水运公会的老大。他们都对阿信大将酿出的美酒和自己从未吃过的料理感到惊喜不已。在享受美食的同时，他们也能暂时忘记日常生活的烦恼。

【本字幕由极影字幕组协力译制】「一起走吧！」她开口说要去寻找“宝物”。为了守护重要的她，于是我便与她一起踏上这段不可思议的奇妙之旅……仅有一片陆地的世界，分成东西二个联邦，这二个国家长年争战不断。住在东联邦的17岁学生维尔与17岁的军人艾莉森。某日，维尔与艾莉森一起来到了某个村落，遇见了一名以吹牛闻名的老人。这名老人告诉了他们「有个能让战争结束之极具价值的宝物」。不过，后来那名老人竟然在他们眼前被人绑走…… 为了拯救这名老人，维尔与艾莉森发挥了行动力与智慧，展开了一场冒险行动。